马英九基金会风波越演越烈，媒体报导前国安会秘书长金溥聪衔命处理基金会人事案，报导指出有人一直以马办名义在大陆做一些事，让马英九深感不妥。对此前基金会执行长、国民党副主席萧旭岑表示，任何想要破坏两岸和平与两岸青年交流的恶势力，一定坚决对抗到底。

萧旭岑指出，有关媒体报导，很多不分党派，相信他为人的好朋友都来关心打气，有人持续用影射的方式匿名放话，试图抹杀人格与最单纯的两岸交流，“我绝对正面以对。”

他也解释从离开基金会到现在都没有针对这件事做积极的回应，原因有二：第一，如今两岸和平、台湾能源政策等大是大非的事情，等着国民党去推进，不希望基金会的内部风波，影响到国民党主席郑丽文以及国民党的推动。

第二，对马英九感念与感谢，马对他有恩，因此即便他可能会遭受一些误解，他也要维护马英九以及马家人。“但不代表有心人士可以利用这一点，疯狂对我抹黑，打击两岸关系。”

萧旭岑祝福马英九基金会未来继续努力，为台湾前领导人马英九以及两岸交流加油。但如果针对他个人的操守继续抹黑或不实指控，一定捍卫到底。任何想要破坏两岸和平与两岸青年交流的恶势力，一定坚决对抗到底。