据深圳发布，新皇岗口岸竣工使用后，将会采用“一地两检”的安排，并实施“合作查验、一次放行”的通关模式，通关时间将由原来的20分钟缩短至5分钟，并与深圳地铁7号线及香港地铁北环支线等5条轨道线路相连。

10月1日，新皇岗口岸联检大楼项目地下室主体结构B1层最后一块梁板顺利浇筑完成，项目建设取得阶段性进展，为后续的地上主体结构施工奠定了坚实的基础。

10月8日，香港特区政府保安局局长邓炳强在出席立法会保安事务委员会会议时透露，香港特区政府正与深圳市政府共同全力推进皇岗口岸和沙头角口岸重建项目。会上，邓炳强表示，新皇岗口岸重建项目力争2025年底基本完成皇岗口岸联检大楼的建设。

设计日通关量约20万人次

新皇岗口岸联检大楼项目总占地面积8.75万平方米，总建筑面积约68.97万平方米，于2021年5月开始组织基坑工程施工。

新皇岗口岸设计的通关流量约为每日20万人次，而在港铁北环线支线开通后，更可以提升至每日约30万人次，跨境车辆的设计通关流量则大约为每日1万5千架次。

同时，深港两地会在口岸开通之后不断监测通关流量，并利用创新科技和其他可行的方法提升旅客通关效率，以应付日后的实际旅客流量。