1627年正月，皇太极发兵攻打背后的朝鲜与毛文龙部，史称丁卯之役。作战意图很明显，消灭位于其后方的不安定因素，为下一步攻打山海关消除隐患，而此时的袁崇焕又是如何做的呢？在朝廷命令之下，派遣9000大军前出三岔河“救援”。手下的7万大军依旧在其梦幻般的类似法国为防止德国突袭一般构筑的“马其顿防线”里热火朝天，修造营垒。三个月时间，不曾有一战，四月份朝鲜臣服后金，毛文龙部陆上占领区全部丧失，此战中毛文龙全家400多口死难。

似乎毛文龙与袁崇焕的梁子也大抵结下了，只不过诧异的是，接下来并不是损失惨重的毛文龙找袁大人麻烦，而是袁大人发自内心的“文龙可用则用之，不可用则去之易易耳。”1629年六月初五，袁崇焕“巧施妙计诛文龙，大明哀叹痛失长城”。以双岛阅兵议饷为由，以崇祯帝所赐尚方宝剑，以所谓“十二大罪”斩杀毛文龙。而这之后似乎袁崇焕才真正成为辽东的一方霸主。然而好景不长，也就在这一年，皇太极在收拾了后方之后，从蒙古部绕过山海关直抵京师，而袁崇焕则在随后也被以凌迟处死。

而关于袁崇焕与毛文龙，似乎也成了一桩公案，毛文龙该不该杀？是不是真的乃是不受节制？

而也就在大清王朝灭亡之后，专家们在整理清朝文档时，发现了其中端倪，六封所谓的毛文龙与后金的来往书信。信中更是有“若是你取山海关，我取山东，两方夹击，则大事顿成矣”，似乎也为毛文龙和棺定论，袁崇焕诛杀毛文龙在情在理。

1576年，毛文龙出生在浙江杭州，少年时读书屡次不中，而后毅然投笔从戎，1605年，他成为了名将李成梁的亲兵。更是在同年武举乡试中拿到第六名，1619年，在熊廷弼手下被擢升为都司。1621年，镇江大捷中将佟养真（康熙的姥爷）及其子佟丰年、其侄佟松年等全部擒获，送往北京。也正是在1621年起，他派遣了大量人员，刺探情报，袭扰后方，而也正合熊廷弼的策略，后金方面更是“疑惧益甚，凛凛终日，日惟追杀毛兵奸细。”

为此，他经常写信投诚的老对手努尔哈赤不胜其烦，直接下令禁止兵卒与汉人交往，不允许去汉人之家，若与汉人交往，去汉人之家，则治以大罪。”（《满文老档》）更有甚者，他还利用1629年，后金国中大闹饥荒，物价飞涨，意图策反本已经投降努尔哈赤的将领李永芳——第一位投降后金的将领，也是努尔哈赤的孙女婿。

1623年努尔哈赤率军准备攻打山海关一线，也正是他毛文龙率兵牵扯，直捣黄龙，连克后金原首都赫图阿拉以南的董骨寨、牛毛寨、阎王寨三座要塞。即便是袁崇焕为人乐道的宁远大捷也不过斩首269颗人头，而牛毛寨大捷便斩杀371颗人头。

袁崇焕斩杀毛文龙后，此时的皮岛，东江镇也终于成为了一个真正的不受控制之地。现在关于袁崇焕该不该杀毛文龙的争议很大。

毛文龙肯定不该杀，正因为袁崇焕擅杀了毛文龙，给自己埋下埋下祸根，再就是毛文龙被杀后，导致东江镇分崩离析，大部分人员投靠了满清。由于走投无路都投降后金了，而且给后金带来了最先进的火器部队。袁崇焕杀毛文龙就好比给后金一个投名状。

毛文龙一直是后金的眼中钉肉中刺，结果轻易被自己人给杀了，此事关键在于从此之后，满清再无后顾之忧。在袁崇焕杀毛文龙7天后，皇太极就商议进攻明朝，毛文龙被杀3个月之后金就开始全力攻明朝。由此也可见毛文龙驻守东江的重要性。

当然毛文龙的个人的毛病是不少，贪墨，擅杀，吃空饷，冒领军功，但这些事情明朝边将都这样，即便袁崇焕也是一样，但毛文龙大节无亏，一直是战斗在抗金一线。